报告专家：于彬教授（青岛科技大学大学）

报告题目：基于深度学习的单细胞RNA-seq聚类方法研究

报告地点：J9-425

报告时间：2021年12月17日下午4:30

报告简介：

单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 技术作为最新一代测序技术，能够独立提供每个细胞的 RNA 表达谱，曾被Science杂志列为年度最值得关注的六大领域榜首。深入挖掘scRNA-seq数据信息对肿瘤研究、细胞免疫研究以及脑神经学研究等多个领域具有重要作用，对临床疾病的诊断以及治疗也有重要指导意义，因此scRNA-seq数据分析与建模是生物信息学的前沿和热点研究领域。随着测序技术的不断发展，规模更大的scRNA-seq数据不断涌现，发展准确高效的scRNA-seq数据分析与建模方法对生物医学研究具有重要意义。本报告主要包括三个方面的内容：

1. 基于scGMAI的单细胞RNA-seq聚类方法研究；

2. 基于自编码网络与二分K均值的单细胞RNA-seq聚类方法研究；

3. 基于生成对抗网络的单细胞RNA-Seq聚类研究。

专家个人简介：

于彬，教授，硕士生导师。青岛科技大学数理学院人工智能与生物医学大数据研究中心主任。2005年6月毕业于上海大学理学院计算数学专业，中国科学技术大学在职博士，加拿大University of Calgary访问学者。目前主要从事人工智能、机器学习、数据挖掘、生物医学图像处理、生物信息学的研究。教育部学科评估专家，教育部学位中心评审专家。中国计算机学会生物信息学专业委员会执行委员，中国自动化学会智能健康与生物信息专业委员会委员，山东省生物信息学学会 (筹) 秘书长。近年来主持国家自然科学基金面上项目 (1项)、山东省重点研发计划项目 (1项)、山东省自然科学基金面上项目 (2项)、教育部产学合作协同育人项目 (1项)、山东省高等学校科技计划项目 (2项)、山东省重点实验室开放基金 (1项)、海南省重点实验室开放基金 (1项)、青岛海尔集团研发项目 (2项)。承担国家自然科学基金项目 (2项)、国家社会科学基金项目 (1项)、山东省自然科学基金项目 (5项)、山东省优秀中青年科学家科研奖励基金计划项目 (1项)、山东省高等学校科技计划项目 (3项)、青岛市科技计划基础研究项目 (2项) 等科研项目25项。2012、2014、2017年三次获山东省高校科研成果二等奖，2008、2009、2016年三次获山东省高校科研成果三等奖。近年来在相关研究领域的主要期刊发表学术论文90余篇，参编著作两部。其中70余篇作为第一作者或通讯作者发表在SCI (包括中科院1区、2区TOP期刊)、EI等国际三大检索刊物上。多次受邀担任IEEE Transactions on Cybernetics、Information Fusion、Bioinformatics、Briefings in Bioinformatics、 Knowledge-Based Systems、PLOS Computational Biology、Applied Soft Computing、IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics、BMC Genomics、International Journal of Biological Sciences、Journal of Proteome Research、IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics、Neural Computing and Applications、Computers in Biology and Medicine、Biomedical Signal Processing and Control、Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems、Journal of Biomedical Informatics、Methods、IEEE Access、BMC Microbiology、Soft Computing、Scientific Reports、Biotechnology Journal、Molecular Genetics and Genomics、BMC Bioinformatics、PLoS One、ACS Omega、SAR and QSAR in Environmental Research、Computational Biology and Chemistry、Current Topics in Medicinal Chemistry、Mathematical Biosciences、Neural Processing Letters、FEBS Letters、Current Bioinformatics、Journal of Molecular Graphics & Modelling、Wireless Personal Communications、International Journal of Pattern Recognition and Artificial Intelligence等SCI期刊审稿人。

近年来获校教学研究一、二等奖9项。指导研究生获得山东省优秀硕士学位论文，山东省优秀成果奖，青岛科技大学第十届研究生“学术之星”，校优秀硕士毕业论文。指导本科生参加国家大学生创新计划项目1项及中国科学院大学生创新计划项目3项。指导本科生毕业论文4次获得山东省优秀学士学位论文，10次获得校级优秀毕业论文。